Mitochondrial long chain fatty acid beta-oxidation (Danio rerio)

From WikiPathways

You do not have permission to edit pages, for the following reasons:

• You do not have permission to edit pages in the Pathway namespace.
• You are not allowed to execute the action you have requested.

You can view and copy the source of this page:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <Pathway xmlns="http://pathvisio.org/GPML/2013a" Name="Mitochondrial LC-Fatty Acid Beta-Oxidation" Organism="Danio rerio" Last-Modified="10/17/2013"> <Comment Source="GenMAPP notes">mitochondrial beta-oxidation of dietary long chain fatty acids</Comment> <Comment Source="GenMAPP remarks">Adapted from GenMAPP</Comment> <Comment Source="WikiPathways-category">Metabolic Process</Comment> <Graphics BoardWidth="750.0" BoardHeight="753.3333333333334"/> <DataNode TextLabel="acadl" GraphId="aa787" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="acadl | acyl-Coenzyme A dehydrogenase long ch..."/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="443.3333333333333" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="394156"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:101627" GraphId="ad655" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:101627 | zgc:101627"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="340.0" Width="73.33333333333333" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="492806"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="acadm" GraphId="cebd6" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="acadm | acyl-Coenzyme A dehydrogenase C-4 to ..."/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="463.3333333333333" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="406283"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ACSL2" GraphId="c69b0" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="Fatty Acid CoA Ligase 2"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="100.0" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="" ID=""/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:112155" GraphId="cab45" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:112155 | zgc:112155"/> <Graphics CenterX="246.66666666666666" CenterY="576.6666666666666" Width="73.33333333333333" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="550422"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="DCI" GraphId="d7f85" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="dci"/> <Graphics CenterX="430.0" CenterY="576.6666666666666" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="334101"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:77634" GraphId="b7728" Type="GeneProduct"> <Comment Source="GenMAPP remarks"/> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:77634 | zgc:77634"/> <Graphics CenterX="186.66666666666666" CenterY="700.0" Width="66.66666666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="393839"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:77526" GraphId="ad1c9" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:77526 | zgc:77526"/> <Graphics CenterX="623.3333333333334" CenterY="576.6666666666666" Width="66.66666666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="404600"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:92400" GraphId="ab0b6" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:92400 | zgc:92400"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="480.0" Width="66.66666666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="445288"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:64067" GraphId="f6364" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:64067 | zgc:64067"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="423.3333333333333" Width="66.66666666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="322180"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="CPT1A" GraphId="d0038" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="Carnitine O-palmitoyltransferase I"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="206.66666666666666" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="" ID=""/> </DataNode> <DataNode TextLabel="zgc:86777" GraphId="d214b" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="zgc:86777 | zgc:86777"/> <Graphics CenterX="623.3333333333334" CenterY="636.6666666666666" Width="66.66666666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="445121"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="HADHA" GraphId="cbe12" Type="GeneProduct"> <Comment Source="GenMAPP remarks">similiar to: ECHA_RAT</Comment> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="hadha"/> <Graphics CenterX="623.3333333333334" CenterY="656.6666666666666" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="553401"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ACSL3" GraphId="cdf25" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="acsl3"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="120.0" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="559656"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="acsl4" GraphId="d8485" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="acsl4 | acyl-CoA synthetase long-chain family m..."/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="140.0" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="393622"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="SLC25A20" GraphId="a9a1e" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="slc25a20"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="273.3333333333333" Width="73.33333333333333" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="393833"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ACSL1" GraphId="e5548" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="acsl1"/> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="80.0" Width="60.0" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="Entrez Gene" ID="555308"/> </DataNode> <Interaction GraphId="idf3e7b018"> <Graphics ZOrder="12288" LineStyle="Broken" LineThickness="1.0" Color="ff8000"> <Point X="93.33333333333333" Y="260.0"/> <Point X="710.0" Y="256.6666666666667"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id3056072d"> <Graphics ZOrder="12288" LineStyle="Broken" LineThickness="1.0" Color="ff8000"> <Point X="96.66666666666667" Y="293.3333333333333"/> <Point X="720.0" Y="290.0"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="ided2b1096"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="240.0" Y="510.0"/> <Point X="240.0" Y="533.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="ida5e850ea"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="596.6666666666666" Y="510.0"/> <Point X="596.6666666666666" Y="533.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idcd3cdf1d"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="620.0" Y="556.6666666666666"/> <Point X="620.0" Y="600.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idb708f4bb"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="213.33333333333334" Y="723.3333333333334"/> <Point X="130.0" Y="663.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id56ac800"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="410.0" Y="386.6666666666667"/> <Point X="410.0" Y="510.0"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idd722197c"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="240.0" Y="510.0"/> <Point X="596.6666666666666" Y="510.0"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="iddbbe7725"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="620.0" Y="613.3333333333334"/> <Point X="620.0" Y="680.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idbeeed3ba"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="236.66666666666666" Y="556.6666666666666"/> <Point X="236.66666666666666" Y="613.3333333333334"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idd772f2c"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="393.3333333333333" Y="616.6666666666666"/> <Point X="416.6666666666667" Y="616.6666666666666"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id54b91bf3"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="416.6666666666667" Y="616.6666666666666"/> <Point X="416.6666666666667" Y="543.3333333333334"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id76f0d30f"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="416.6666666666667" Y="543.3333333333334"/> <Point X="496.6666666666667" Y="543.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id5f754bad"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="236.66666666666666" Y="613.3333333333334"/> <Point X="253.33333333333334" Y="613.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id36c4963"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="160.0" Y="666.6666666666666"/> <Point X="166.66666666666666" Y="660.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id21281753"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="133.33333333333334" Y="633.3333333333334"/> <Point X="133.33333333333334" Y="473.3333333333333"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id5c9a8a0f"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="133.33333333333334" Y="473.3333333333333"/> <Point X="313.3333333333333" Y="376.6666666666667" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="ide61ee53b"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="596.6666666666666" Y="696.6666666666666"/> <Point X="556.6666666666666" Y="723.3333333333334"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="ida927bb1d"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="556.6666666666666" Y="723.3333333333334"/> <Point X="213.33333333333334" Y="723.3333333333334"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idf1e3fd6d"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="410.0" Y="250.0"/> <Point X="410.0" Y="363.3333333333333" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id37cd22a9"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="410.0" Y="186.66666666666666"/> <Point X="410.0" Y="233.33333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idfe7d2de6"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="410.0" Y="60.0"/> <Point X="410.0" Y="166.66666666666666" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Label TextLabel="Long chain Acyl-CoA" GraphId="c9695"> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="176.66666666666666" Width="166.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="Long chain Acyl-CoA" GraphId="b0564"> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="373.3333333333333" Width="166.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="trans-" GraphId="e01c9"> <Graphics CenterX="536.6666666666666" CenterY="543.3333333333334" Width="49.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="3-Ketoacyl-CoA" GraphId="f90c4"> <Graphics CenterX="620.0" CenterY="686.6666666666666" Width="101.33333333333333" Height="16.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="10" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="saturated" GraphId="ceca8"> <Graphics CenterX="530.0" CenterY="496.6666666666667" Width="71.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontStyle="Italic" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="unsaturated" GraphId="ec1a1"> <Graphics CenterX="283.3333333333333" CenterY="496.6666666666667" Width="89.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontStyle="Italic" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="mitochondrial matrix" GraphId="bc76f"> <Graphics CenterX="156.66666666666666" CenterY="336.6666666666667" Width="170.33333333333334" Height="22.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontStyle="Italic" FontSize="14" Valign="Middle" Color="800000"/> </Label> <Label TextLabel="cytosol" GraphId="dd1ce"> <Graphics CenterX="120.0" CenterY="193.33333333333334" Width="62.333333333333336" Height="22.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontStyle="Italic" FontSize="14" Valign="Middle" Color="800000"/> </Label> <Label TextLabel="-Enoyl-CoA" GraphId="b8e6a"> <Graphics CenterX="620.0" CenterY="543.3333333333334" Width="92.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="Acyl-CoA (n-2)" GraphId="f1544"> <Graphics CenterX="103.33333333333333" CenterY="650.0" Width="114.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="2,4 Dienoyl-CoA" GraphId="f787d"> <Graphics CenterX="230.0" CenterY="546.6666666666666" Width="127.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="Acetyl-CoA" GraphId="f576a"> <Graphics CenterX="206.66666666666666" CenterY="650.0" Width="74.33333333333333" Height="16.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="D" GraphId="a7755"> <Graphics CenterX="566.6666666666666" CenterY="543.3333333333334" Width="16.333333333333332" Height="20.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontName="Symbol" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="2" GraphId="d987c"> <Graphics CenterX="573.3333333333334" CenterY="533.3333333333334" Width="14.333333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="3-L-Hydroxyacyl-CoA" GraphId="e86ef"> <Graphics CenterX="623.3333333333334" CenterY="610.0" Width="136.33333333333334" Height="16.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="10" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="Long chain acyl-carnitine" GraphId="f70fb"> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="243.33333333333334" Width="197.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="Long chain acyl-carnitine" GraphId="ece45"> <Graphics CenterX="406.6666666666667" CenterY="310.0" Width="197.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="cis-" GraphId="e2354"> <Graphics CenterX="266.6666666666667" CenterY="610.0" Width="32.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="D-" GraphId="fddbf"> <Graphics CenterX="293.3333333333333" CenterY="613.3333333333334" Width="26.333333333333332" Height="20.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontName="Symbol" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="-Enoyl-CoA" GraphId="c2c89"> <Graphics CenterX="350.0" CenterY="613.3333333333334" Width="92.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="3" GraphId="a84fe"> <Graphics CenterX="300.0" CenterY="606.6666666666666" Width="14.333333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="Acyl-CoA dehydrogenases:" GraphId="cd9d8"> <Graphics CenterX="410.0" CenterY="400.0" Width="215.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="Long Chain Fatty Acid" GraphId="fa516"> <Graphics CenterX="406.6666666666667" CenterY="50.0" Width="174.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="0000ff"/> </Label> <Label TextLabel="HOMOLOGY MAPP" GraphId="ce7d3"> <Graphics CenterX="56.666666666666664" CenterY="20.0" Width="85.33333333333333" Height="18.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle" Color="008000"/> </Label> <Shape GraphId="eced2"> <Graphics CenterX="163.33333333333334" CenterY="676.6666666666666" Width="20.0" Height="10.0" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="1.570796"/> </Shape> <InfoBox CenterX="548.3333333333334" CenterY="45.0"/> <Legend CenterX="605.1333333333333" CenterY="34.96666666666667"/> <Biopax> <bp:openControlledVocabulary xmlns:bp="http://www.biopax.org/release/biopax-level3.owl#"> <bp:TERM xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">fatty acid beta degradation pathway</bp:TERM> <bp:ID xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">PW:0000738</bp:ID> <bp:Ontology xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#string">Pathway Ontology</bp:Ontology> </bp:openControlledVocabulary> </Biopax> </Pathway>

Return to Mitochondrial long chain fatty acid beta-oxidation (Danio rerio).