Mevalonate pathway (Saccharomyces cerevisiae)

From WikiPathways

You do not have permission to edit pages, for the following reasons:

• You do not have permission to edit pages in the Pathway namespace.
• You are not allowed to execute the action you have requested.

You can view and copy the source of this page:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?> <Pathway xmlns="http://pathvisio.org/GPML/2013a" Name="Mevalonate pathway" Organism="Saccharomyces cerevisiae"> <Comment Source="GenMAPP remarks">Based on http://pathway.yeastgenome.org/biocyc/</Comment> <Comment Source="WikiPathways-category">Metabolic Process</Comment> <Comment Source="WikiPathways-description">Pyridoxal phosphate (PLP) is the active form of vitamin B&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt; and is a cofactor in many reactions of amino acid metabolism. Pyridoxine (PN), pyridoxamine (PM), pyridoxal (PL), pyridoxine 5'-phosphate (PNP) and pyridoxamine 5'-phosphate (PMP) are all forms of vitamin B&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt; that can be converted to PLP via the PLP salvage pathway. Most unicellular organisms and plants can synthesize PLP, whereas mammals cannot and require vitamin B&lt;sub&gt;6&lt;/sub&gt; in their diet. Thus far, three PLP biosynthetic pathways have been characterized: the de novo PLP biosynthesis pathway as characterized in &lt;I&gt;Escherichia coli&lt;/I&gt; (CITS: [12686115]), the de novo PLP biosynthesis pathway as being studied in fungi (CITS: [15483325],[14764090]), and the PLP salvage pathway (CITS: [15483325], [17696614],[8764513],[9537380]). &lt;I&gt;Saccharomyces cerevisiae&lt;/I&gt; synthesize PLP via the fungal type de novo PLP synthesis pathway and the PLP salvage pathway (CITS: [7896706], [17696614], [15483325], [14764090]). Extracellular PN, PL and PM are transported into the cell by Tpn1p, a member of the purine-cytosine permease family (CITS: [12649274]). SOURCE: SGD pathways, http://pathway.yeastgenome.org/server.html</Comment> <Graphics BoardWidth="762.8333333333333" BoardHeight="816.1666666666666"/> <DataNode TextLabel="ERG10" GraphId="d20" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="ERG10"/> <Graphics CenterX="283.3333333333333" CenterY="53.333333333333336" Width="46.666666666666664" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000005949"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ARG5,6" GraphId="c95" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="ARG5,6"/> <Graphics CenterX="540.0" CenterY="166.66666666666666" Width="53.333333333333336" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000000871"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="HMG2" GraphId="a8f" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="HMG2"/> <Graphics CenterX="356.6666666666667" CenterY="276.6666666666667" Width="53.333333333333336" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000004442"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ERG12" GraphId="c75" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="ERG12"/> <Graphics CenterX="176.66666666666666" CenterY="390.0" Width="46.666666666666664" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000004821"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ERG8" GraphId="b45" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="ERG8"/> <Graphics CenterX="333.3333333333333" CenterY="490.0" Width="49.61756666666667" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000004833"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="MVD1" GraphId="a12" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="MVD1"/> <Graphics CenterX="533.3333333333334" CenterY="643.3333333333334" Width="46.666666666666664" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000005326"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="IDI1" GraphId="b96" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="IDI1"/> <Graphics CenterX="333.3333333333333" CenterY="763.3333333333334" Width="41.9841" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000006038"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="HMG1" GraphId="b49" Type="GeneProduct"> <Attribute Key="org.pathvisio.model.BackpageHead" Value="HMG1"/> <Graphics CenterX="356.6666666666667" CenterY="256.6666666666667" Width="53.333333333333336" Height="20.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle"/> <Xref Database="SGD" ID="S000004540"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="2 acetyl-CoA" GraphId="c9d" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="53.333333333333336" CenterY="66.66666666666667" Width="101.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="72-89-9"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="Coenzyme A" GraphId="b0b" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="343.3333333333333" CenterY="103.33333333333333" Width="102.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="64885-97-8"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="acetoacetyl-CoA" GraphId="a98" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="576.6666666666666" CenterY="66.66666666666667" Width="130.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="1420-36-6"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="acetyl-CoA" GraphId="d64" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="643.3333333333334" CenterY="126.66666666666667" Width="88.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="72-89-9"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="Coenzyme A" GraphId="b9c" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="656.6666666666666" CenterY="213.33333333333334" Width="102.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="64885-97-8"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="Coenzyme A" GraphId="f25" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="310.0" CenterY="336.6666666666667" Width="102.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="64885-97-8"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="2 NADPH" GraphId="fad" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="413.3333333333333" CenterY="336.6666666666667" Width="76.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="53-57-6"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ATP" GraphId="b94" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="96.66666666666667" CenterY="346.6666666666667" Width="37.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="1927-31-7"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ADP" GraphId="d95" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="93.33333333333333" CenterY="433.3333333333333" Width="39.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="58-64-0"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ATP" GraphId="f36" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="273.3333333333333" CenterY="546.6666666666666" Width="37.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="1927-31-7"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ADP" GraphId="c82" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="393.3333333333333" CenterY="546.6666666666666" Width="39.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="58-64-0"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ATP" GraphId="f26" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="446.6666666666667" CenterY="596.6666666666666" Width="37.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="1927-31-7"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="ADP" GraphId="d32" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="436.6666666666667" CenterY="690.0" Width="39.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="58-64-0"/> </DataNode> <DataNode TextLabel="phosphate" GraphId="f47" Type="Metabolite"> <Graphics CenterX="436.6666666666667" CenterY="706.6666666666666" Width="87.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="32768" FontSize="10" Valign="Middle" Color="0000ff"/> <Xref Database="CAS" ID="14265-44-2"/> </DataNode> <Interaction GraphId="id5fb23dbf"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="110.0" Y="66.66666666666667"/> <Point X="506.6666666666667" Y="66.66666666666667" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idc0b8914b"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="570.0" Y="76.66666666666667"/> <Point X="570.0" Y="280.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idf48eec62"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="596.6666666666666" Y="213.33333333333334"/> <Point X="603.3333333333334" Y="213.33333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idd3c73141"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="476.6666666666667" Y="290.0"/> <Point X="200.0" Y="290.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id743cffee"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="310.0" Y="316.6666666666667"/> <Point X="310.0" Y="326.6666666666667" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id87534d8"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="150.0" Y="296.6666666666667"/> <Point X="150.0" Y="493.3333333333333" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idd0cbe966"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="123.33333333333333" Y="433.3333333333333"/> <Point X="113.33333333333333" Y="433.3333333333333" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idc065dbe6"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="213.33333333333334" Y="503.3333333333333"/> <Point X="456.6666666666667" Y="503.3333333333333" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idda370037"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="393.3333333333333" Y="530.0"/> <Point X="393.3333333333333" Y="536.6666666666666" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id4a4cc098"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="506.6666666666667" Y="513.3333333333334"/> <Point X="506.6666666666667" Y="763.3333333333334" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="idb5a2b6bb"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="473.3333333333333" Y="690.0"/> <Point X="466.6666666666667" Y="690.0" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id528b2d8a"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="423.3333333333333" Y="776.6666666666666"/> <Point X="233.33333333333334" Y="776.6666666666666" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Interaction GraphId="id80fb13ea"> <Graphics ZOrder="12288" LineThickness="1.0"> <Point X="170.0" Y="66.66666666666667"/> <Point X="313.3333333333333" Y="93.33333333333333" ArrowHead="Arrow"/> </Graphics> <Xref Database="" ID=""/> </Interaction> <Label TextLabel="3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-CoA" GraphId="f3b"> <Graphics CenterX="606.6666666666666" CenterY="290.0" Width="252.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="2 NADP" GraphId="af5"> <Graphics CenterX="310.0" CenterY="356.6666666666667" Width="64.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="mevalonate" GraphId="ff6"> <Graphics CenterX="150.0" CenterY="290.0" Width="93.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="mevalonate-5P" GraphId="ad6"> <Graphics CenterX="153.33333333333334" CenterY="503.3333333333333" Width="118.33333333333333" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="mevalonate-5-PP" GraphId="eee"> <Graphics CenterX="503.3333333333333" CenterY="503.3333333333333" Width="134.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="delta3-isopentenyl-PP" GraphId="f05"> <Graphics CenterX="510.0" CenterY="776.6666666666666" Width="172.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="dimethylallyl-pyrophosphate" GraphId="f27"> <Graphics CenterX="116.66666666666667" CenterY="776.6666666666666" Width="222.33333333333334" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="H2O" GraphId="c66"> <Graphics CenterX="623.3333333333334" CenterY="143.33333333333334" Width="38.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Label TextLabel="CO2" GraphId="c36"> <Graphics CenterX="436.6666666666667" CenterY="726.6666666666666" Width="38.333333333333336" Height="19.0" ZOrder="28672" FillColor="ffffff" FontWeight="Bold" FontSize="12" Valign="Middle"/> </Label> <Shape GraphId="eb8"> <Graphics CenterX="600.0" CenterY="170.0" Width="86.92269333333334" Height="60.0" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="1.570796"/> </Shape> <Shape GraphId="ee4"> <Graphics CenterX="356.6666666666667" CenterY="326.6666666666667" Width="93.57112000000001" Height="73.63574666666666" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="3.141593"/> </Shape> <Shape GraphId="ba3"> <Graphics CenterX="116.66666666666667" CenterY="390.0" Width="86.92269333333334" Height="66.99917333333333" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="4.712389"/> </Shape> <Shape GraphId="d4a"> <Graphics CenterX="333.3333333333333" CenterY="536.6666666666666" Width="120.0" Height="66.66666666666667" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="3.141593"/> </Shape> <Shape GraphId="acd"> <Graphics CenterX="466.6666666666667" CenterY="643.3333333333334" Width="93.57112000000001" Height="80.0" ZOrder="16384" FontSize="10" Valign="Middle" ShapeType="Arc" Rotation="4.712389"/> </Shape> <InfoBox CenterX="648.3333333333334" CenterY="765.0"/> <Legend CenterX="0.0" CenterY="0.0"/> <Biopax><bp:openControlledVocabulary xmlns:bp="http://www.biopax.org/release/biopax-level3.owl#"><bp:TERM>classic metabolic pathway</bp:TERM><bp:ID>PW:0000002</bp:ID><bp:Ontology>Pathway Ontology</bp:Ontology></bp:openControlledVocabulary></Biopax></Pathway>

• Template:AuthorInfo
• Template:CheckAvailable (protected)
• Template:PathwayPage:History
• Template:PathwayPage:Xrefs

Return to Mevalonate pathway (Saccharomyces cerevisiae).