Ajuda: Etapa 7
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Ciclo de retroalimentação negativa
O último evento que vamos adicionar ao caminho é a retroalimentação negativa formada pelo MPER / dimer mCry. A fim de inibir a expressão dos genes do relógio circadiano, o MPER e proteínas mCry precisam dimerizar e translocar para o núcleo. Depois da dimerização, MPER é protegida da degradação (veja step 6). Uma vez que o dímero está no núcleo, que vai inibir a ativação do elemento E-box -Clock/Bmal1, agindo assim como um feedback negativo. Após este passo, o caminho será parecido com este:
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Cópia de DataNodes mCry e MPER
| Drawing the negative feedback loop |
O ciclo de retroalimentação negativa terá duas variações adicionais sobre as proteínas e mCry MPER:
- O mCry dímero / MPER fora do núcleo
- O mCry dímero MPER / dentro do núcleo
Para adicionar esses DataNodes, você pode copiar o mCry 4 e DataNodes MPER sob a etiqueta adicionada gene na step 6.1 duas vezes e mova-os para local correto (veja imagem acima) .
Desenhar a dimerização do MPER e mCry
Este desenho é semelhante ao desenho da dimerização do Relógio e Bmal1 em step 5.2. Primeiro, copie o mCry 4 e DataNodes MPER sob a etiqueta adicionada gene na step 6.1. Coloque o DataNodes copiado acima / direita do MPER separado e DataNodes mCry, empilhe-os e crie um complexo (selecione todos os quatro DataNodes e pressione CTRL-P). Conecte duas setas do MPER individuais e elementos mCry ao recém-criado MPER / complexo mCry e defina o seu tipo de linha para "curvo".
Desenhar a translocação de MPER / mCry
Depois de dimerização, a MPER / transloque dímero mCry para o núcleo. Não há informações sobre a localização celular no caminho, no entanto, é isto que vai acontecer em step 8, mas já podemos chamar de translocação. Copie o complexo mCry/ MPER / e mova a cópia ao lado do Relógio / Bmal DataNodes. Desenhe e ligue uma seta tracejada entre o dímero original e cópia. Você pode definir o estilo da linha da seta tracejada para "elbol".
Desenhar a inibição da função por Clock/Bmal1 MPER / mCry
O complexo MPER / mCry localizado no núcleo, inibe a ativação do elemento E- box Clock/Bmal1. Esta inibição pode ser representada pela linha T-bar.
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Desenhe e conecte a linha T-bar do complexo MPER / mCry no núcleo para o dímero Clock/Bmal1 vinculada ao E-box usando o 
botão da barra em T- bar na barra de ferramentas.
Adicionar cores aos acontecimentos de degradação e dimerização
Para enfatizar as duas rotas MPER pode ir (degradação ou dimerização com mCry), você pode dar a cada rota uma cor diferente. Altere a cor da seta e da degradação para vermelho. Selecione a forma de seta e da degradação e clique em propiedade cor na tabela de propriedades. Irá aparecer uma janela onde você pode escolher a cor. Repita os mesmos passos para as setas que representam a dimerização, mas agora escolha a cor azul. Next step | Index
