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Bem-vindo ao WikiPathways! Este guia permite que você comece rapidamente a criação de vias com a WikiPathways, com o passo a passo, exemplos de casos de uso mais comum.

Por onde quer começar?

Editar um Caminho Existente

Faça parte da comunidade WikiPathways através da criação de uma conta de usuário.
Busque um caminho para editar.
Para identificar um caminho que precisa de edição, use o sistema de etiqueta de curadoria. Você pode encontrar listas de percursos organizados por etiquetas de curadoria. Por exemplo, os caminhos marcados com o "gene ausente / referências de banco de dados de proteínas" (AusênciaXRef) etiquetas ou as "linhas desconectadas" (sem interação) etiquetas podem ser melhorados através da edição relativamente simples. Você também pode encontrar um caminho através de pesquisa ou busca.

Representação Gráfica da Via

Uma vez que você decidi sobre um caminho para editar, abra a página Caminho para esse caminho.
Clique no link editar via sob a imagem via. Isto irá abrir o caminho em uma versão integrada do programa PathVisio, onde você pode editar o caminho.

O conteúdo é diverso em WikiPathways tanto em estilo e conteúdo. Embora não haja imposição de um estilo de desenho especial, há algumas diretrizes para a edição e estilo gráfico. Nossas diretrizes incluem orientações gerais de edição, bem como uma lista de exemplos caminhos para sua referência. Há também um processo específico para a inclusão de vias em coleções caminho específico na WikiPathways, leia mais sobre ele aqui. Para obter instruções detalhadas sobre como usar o editor PathVisio, consulte a Ajuda PathVisio.

Quando você terminar de editar, salve o caminho no PathVisio clicando no botão "Feche o editor do" botão e, em seguida, retorne à Página Pathway. Clique no botão Atualizar no seu navegador para ver as alterações recentes.

Campos Auxiliares Para Via

Além da representação gráfica do caminho, a página de caminho tem campos de informações adicionais que podem ser editados.

Adicione ou remova etiquetas curadoria relevantes. Por exemplo, se você adicionou referências no banco de dados para todos os dados atribuído no caminho, retire o "gene ausente / proteína de banco de dados referências" etiqueta clicando no botão Remover ao lado da marca. Similarmente, para adicionar uma marca curadoria, clique no botão Nova etiqueta na parte inferior da seção de Etiquetas Curadoria e selecione uma etiqueta no menu drop-down. Por exemplo, se você considerar o trajeto incompleto, adicione as "necessidades de trabalho" na etiqueta.
Para editar a descrição do caminho, clique no link Editar na seção de de
Adicione categoria ao caminho clicando no botão Editar na seção Categorias.

Criar um Novo Caminho no WikiPathways

Faça parte da comunidade WikiPathways através da criação de uma conta de usuário.
Clique Criar miniatura na página principal ou clique no link Criar no painel de navegação à esquerda.
Na página Criar novo caminho, digite um nome para o caminho e, em seguida, selecione as espécies que o caminho fará parte a partir do menu drop-down. Selecionando a opção "Fazer via privada". Esta ação esconde a sua via do resto da comunidade por 30 dias. Consulte a seção sobre Acesso privativo para mais detalhes. Clique no botão Criar um caminho para continuar.
PathVisio será aberto com uma mesa de desenho em branco. Crie o seu caminho em PathVisio.
Para obter informações sobre as diretrizes de edição, consulte nossas diretrizes Gerais de edição e nossa lista de exemplo percursos. Para obter instruções sobre como usar PathVisio, consulte a Ajuda PathVisio].
Quando o seu caminho estiver completo, clique no botão "Fechar o editor" para enviar o seu caminho para WikiPathways. Uma nova janela do navegador será aberta com a página do caminho para o seu caminho recém-criado na WikiPathways.
Adicione informações sobre o seu percurso, editando os campos de texto na página Pathway. Lembre-se de atribuir uma categoria para o seu caminho para que o caminho apareça na Browse página de listagem de todas as vias classificadas na WikiPathways.

Transferência de Via de GenMAPP para WikiPathways

Você pode transferir um caminho que você criou no programa GenMAPP para WikiPathways.

Faça parte da comunidade WikiPathways através da criação de uma conta de usuário.
Clique Criar miniatura na página principal ou clique no link Criar no painel de navegação à esquerda.
Na página Criar novo caminho, digite um nome para o caminho e, em seguida, selecione as espécies que o caminho é para a partir do menu drop-down. Clique no botão Criar um caminho para continuar.
PathVisio será aberto com uma mesa de desenho em branco. Para acessar o seu caminho GenMAPP existente, vá para File>Import e selecione o .mapp arquivo adequado.
Faça as alterações necessárias para a via na PathVisio.
Quando seu caminho estiver completo, clique no botão "Fechar o editor" para enviar o seu caminho para WikiPathways. Uma nova janela do navegador será aberta com a página do caminho para o seu caminho recém-criado na WikiPathways.
Adicione informações sobre o seu percurso, editando os campos de texto na página Pathway. Lembre-se de atribuir uma categoria para o seu caminho para que o caminho apareça nas listas de todos os percursos na WikiPathways.