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Estes tutoriais explicam como criar um caminho em WikiPathways, utilizando a via do relógio circadiano como exemplo.

A Via do Relógio Circadiano

O relógio circadiano é um mecanismo molecular que mantém ritmo de 24 horas da pilha molecular dirigindo a expressão rítmica de uma ampla gama de genes envolvidos na fisiologia, metabolismo e comportamento. Neste tutorial, você vai desenhar uma versão simplificada da via, restringindo a MPER / feedback mCry.


Passo a Passo para Desenhar a Via do Ciclo circadiano

As páginas a seguir mostram o passo-a-passo como desenhar uma versão simplificada da via do relógio circadiano, como descrito na seção acima.


Tutoriais Avançados

Uso do Caminho do Relógio Circadiano em GenMAPP

O próximo tutorial mostra como usar o caminho que você criou para visualizar os dados experimentais com GenMAPP.

Extensão de Vias e layout usando Cytoscape

Cytoscape é uma ferramenta para visualização e análise de rede. Nos tutoriais a seguir, vamos destacar algumas das funcionalidades Cytoscape que é relevante para os percursos utilizados em WikiPathways. Para tutoriais de outros recursos Cytoscape, consulte o Cytoscape wiki. Os tutoriais a seguir mostram dois plugins de trabalho, o Agilent Literature Search plugin e o Bubblerouter plugin.

Analisando Dados com PathVisio

Esses tutoriais mostram como usar as vias WikiPathways em PathVisio.


Termos Comumente Usados

Sidepanel (painel ao lado)
O painel que contém Propriedades e separadores do verso (1B ver imagem).
Área de Desenho
A área em que o caminho é desenhado (1A ver imagem).
Tabela de propierades
A mesa onde você pode editar as propriedades do objeto selecionado (s). A tabela de propriedade está localizada no painel ao lado sob a guia chamada 'Propriedades'.
Verso navegador
um painel que dá informações detalhadas sobre a anotação DataNode selecionado. O navegador Verso está localizado no painel ao lado sob a aba chamada 'Verso'.
Barra de ferramentas
Ver 1C screenshot.
Infomações
Exibe informações sobre a via (ver imagem 1D).
editor_screenshot.png
Screenshot 1: the editor applet




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